L'hydrogène en tant que gaz médical est également en plein essor car il a des applications médicales immédiates pour aider à résoudre de nombreuses crises sanitaires actuelles. Dixon et ses collègues de l'Université de Loma-Linda ont rapporté que l'hydrogène a le potentiel d'aider à résoudre les 8/10 principaux décès causant des maladies répertoriés par les Centers of Disease Control.  Le Dr Banks , du VA/U de Washington, a rapporté que l'ingestion d'eau riche en hydrogène était protectrice contre les changements neurodégénératifs induits par un traumatisme crânien chez la souris. Leurs résultats montrent que l'administration d'hydrogène réduit l'œdème cérébral, bloque l'expression pathologique de tau et maintient les niveaux d'ATP. Cette étude et d'autres ont des effets profonds pour les événements où les lésions cérébrales (par exemple, commotion cérébrale, encéphalopathie traumatique chronique, etc.) sont fréquentes. Bien que de nombreuses personnes signalent des effets spectaculaires de l'hydrogénothérapie, du soulagement rapide de la douleur et de l'inflammation à la normalisation des niveaux de glucose et de cholestérol, d'autres personnes peuvent ne pas remarquer de bénéfices immédiats ou observables. L'hydrogène n'est pas considéré comme un médicament puissant et, comme mentionné précédemment, il ne fait que rétablir l'homéostasie de la cellule/organe sans provoquer de perturbations majeures. Certains des effets spectaculaires rapportés peuvent peut-être être attribués à l'effet placebo ou à d'autres facteurs, bien que certains chercheurs aient noté que certaines personnes sont plus sensibles à l'hydrogène et ressentent des effets plus importants. D'autres études sur l'homme sont nécessaires pour répondre à ces questions.